ゲノム

Nature Genetics (2023)この記事を引用

6 オルトメトリック

メトリクスの詳細

過食症（BED）は最も一般的な摂食障害ですが、その遺伝子構造は依然としてほとんど知られていません。 BED は一般的かつ高度に多遺伝子性の形質である肥満と併発することが多く、バイオバンクのデータセットでは過少診断されているため、BED の研究は困難です。 この制限に対処するために、私たちは教師あり機械学習アプローチ (BED と診断された個人の 822 例を使用) を適用し、ミリオン ベテラン プログラムの電子医療記録に基づいて各個人が BED になる確率を推定します。 私たちは、アフリカ系 (n = 77,574) とヨーロッパ人 (n = 285,138) の祖先を持つ個人のゲノムワイド関連研究を BMI を制御しながら実施し、HFE、MCHR2、LRP11 遺伝子付近の 3 つの独立した遺伝子座を特定し、APOE がリスクであることを示唆しています。 BEDの遺伝子。 私たちは、BED といくつかの神経精神医学的形質との間の共通の遺伝性を特定し、鉄代謝が BED の病態生理学に関与していることを示唆しています。 全体として、私たちの発見はBEDの根底にある遺伝学への洞察を提供し、将来のトランスレーショナル研究の方向性を示唆しています。

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MVP データからの BED GWAS 概要統計は、dbGaP (アクセッション番号 phs001672) で入手できます。 分割遺伝率解析の外部検証セットとして、マウス赤血球細胞ベータエストラジオール刺激モデルのオープン クロマチン領域 (GEO アクセッション番号 GSE114996)、成人脳のオープン クロマチン アトラス (GEO アクセッション番号 GSE147672)、およびオープン クロマチン アトラスを使用しました。発達中のヒト臓器のクロマチン アトラス (https://descartes.brotmanbaty.org/bbi/human-chromatin-during-development)。 遺伝的相関分析の GWAS 概要統計については、IEU Open GWAS プロジェクト (https://gwas.mrcieu.ac.uk) を参照してください。

この研究で使用されたソフトウェアには、次のプログラムが含まれていました。EIGENSOFT v.6 (https://github.com/dreichlab/eig)。 FUMA v.1.3.7 (https://fuma.ctglab.nl); GCTA v.1.93.2 (https://yanglab.westlake.edu.cn/software/gcta/#Overview); KING v.2.0 (https://www.chen.kingpopularness.com); LD スコア回帰 v.1.0.1 (https://github.com/bulik/ldsc); liftOver v.1.2.0 (https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgLiftOver); Minimac v.3 (https://genome.sph.umich.edu/wiki/Minimac3); 多祖先メタ分析 (https://github.com/JonJala/mama); PheMED (https://github.com/DiseaseNeuroGenomics/PheMED); PRS-CS (https://github.com/getian107/PRScs); echolocatoR72 (https://github.com/RajLabMSSM/echolocatoR) で実装されている SuSiE。

ミッチェル、KS et al. 過食症：責任に対する遺伝的および環境的影響の症状レベルの調査。 サイコル。 医学。 40、1899–1906 (2010)。

論文 CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Reichborn-Kjennerud, T.、Bulik, CM、Tambs, K. & Harris, JR 代償行動がない場合の過食症に対する遺伝的および環境的影響: 集団ベースの双子研究。 内部。 J.食べる。 障害。 36、307–314 (2004)。

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Udo, T. & Grilo, CM 米国成人の全国を代表するサンプルにおける DSM-5 で定義された摂食障害の有病率と相関関係。 バイオル。 精神医学 84、345–354 (2018)。

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